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Zuerst einmal muss man sich die Frage stellen, woher denn der “saure Regen” kommt – damit ist gemeint, dass der Regen keinen “normalen” pH-Wert für Wasser (ungefähr 7), sondern einen geringeren hat. Ursache hierbei ist, dass die Verbrennung vor allem fossiler Brennstoffe, z.B. Erdöl oder Erdgas nicht nur zu Wasser und CO2 abläuft, sondern immer noch andere Substanzen, wie z.B. Schwefelsäure (H2SO4) oder Salpetersäure (HNO3) entstehen, welche den pH-Wert ins saure Milieu verschieben.
Dies hat direkten Einfluss auf das Ökosystem des Baumes, welches ja nicht nur aus dem Baum selbst, sondern auch z.B. aus Pilzen um die Wurzeln besteht. Das veränderte Wasser kann dazu führen, dass diese Pilze, welche durchaus wichtig für den Baum sind, da er mit deren Hilfe bestimmte Substanzen besser aufnehmen kann, absterben. Dadurch kann sich der Baum schlechter ernähren. Ein weiterer Aspekt ist, dass sich durch den sauren Regen die Konzentration an wichtigen Nährstoffen und Ionen, wie z.B. Natrium ändert und zur Freisetzung von toxischen Schwermetallionen führt, was in der Summe die Wurzeln und somit die Aufnahme von Nährstoffen schädigt. Folglich ist der Baum weniger widerstandsfähig und Schädlingsbefall kann ihm leichter zusetzen. Das saure Wasser führt zusätzlich dazu, dass die Blätter Schaden nehmen können. Diese Kombination aus reduzierter Aufnahme von Nährstoffen und erhöhter Belastung durch saures Wasser kann dazu führen, dass der Baum schließlich abstirbt.